En 2009, suite à l’Adoption de la Loi sur le caractère collectif des ressources en eau et visant à en renforcer la protection, le Gouvernement du Québec procède au découpage du Québec méridional en créant 40 zones de gestion intégrée des ressources en eau. Cette initiative avait pour objectif que tous les bassins versants soient considérés dans les processus d’acquisition de connaissance, de conservation et gestion de l’eau. C’est de par cette initiative que le territoire actuel de gestion intégrée de l’eau du Nord-Est du Bas-Saint-Laurent fût créé, une zone de 8 200 km2 incluant les bassins versants entre Trois-Pistoles et les Méchins.
